Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf1Q9CWX2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms