Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms