Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atxn3Q9CVD2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atxn3Q9CVD2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms