Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sppl3Q9CUS9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sppl3Q9CUS9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms