Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rprd1bQ9CSU0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms