Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CRC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CRC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CRC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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