Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg12Q9CQY1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms