Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifitm3Q9CQW9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms