Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ykt6Q9CQW1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms