Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PsenenQ9CQR7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PsenenQ9CQR7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms