Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQF4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms