Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms