Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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