Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQ90 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CQ90 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms