Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb3bpQ9CQ82 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itgb3bpQ9CQ82 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms