Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp3Q9CQ10 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp3Q9CQ10 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms