Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim12aQ99PQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trim12aQ99PQ1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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