Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GpnmbQ99P91 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms