Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms