Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll1Q99NC0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll1Q99NC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms