Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atoh8Q99NA2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atoh8Q99NA2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms