Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl3Q99N95 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl3Q99N95 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms