Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ms4a4dQ99N05 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4dQ99N05 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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