Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp1b4Q99ME6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms