Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms