Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed9Q99KF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms