Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlgn1Q99K10 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlgn1Q99K10 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms