Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tlcd1Q99JT6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms