Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krcc1Q99JT5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms