Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin3Q99JB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms