Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Def8Q99J78 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms