Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc33a1Q99J27 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms