Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CsprsQ99388 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms