Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfdQ925I7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfdQ925I7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfdQ925I7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms