Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csmd1Q923L3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms