Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spdl1Q923A2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spdl1Q923A2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms