Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Afg3l1Q920A7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Afg3l1Q920A7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Afg3l1Q920A7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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