Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarca5Q91ZW3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca5Q91ZW3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms