Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Pde6cQ91ZQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Pde6cQ91ZQ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Pde6cQ91ZQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Pde6cQ91ZQ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Pde6cQ91ZQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Pde6cQ91ZQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Pde6cQ91ZQ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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