Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1fooQ8VIK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms