Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms