Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacng8Q8VHW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacng8Q8VHW2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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