Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms