Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc115Q8VE99 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc115Q8VE99 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms