Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rdh10Q8VCH7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms