Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Exosc2Q8VBV3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc2Q8VBV3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms