Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.3 ms