Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dnaaf4Q8R368 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms