Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11fip5Q8R361 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab11fip5Q8R361 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab11fip5Q8R361 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms