Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg10Q8R1P4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg10Q8R1P4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms